中央情报局特工人员约翰克拉克,拥有许多与杰克瑞安相同的特质,但也同时拥有九十年代后期某些人惯有的偏执：他笃信暴力可以解决一切,认为武力是吓阻恐怖主义的最佳手段。他鉴于在冷战结束后仍有许多恐怖份子继续在世界各地活动,因此向总统提议成立反恐怖活动的部队,以扫除世界上所有的恐怖主义。提议获得同意,克拉克也成了这支部队的总指挥。于是,一支由美国中情局人员,结合英、法、德精英所组成的特种部队便从而诞生,并取名为彩虹,而克拉克就是最高指挥官彩虹六号。彩虹部队刚刚成立,世界上恰巧发生了接二连三的恐怖事件,正好给了反恐精英展露头角的机会。这一连串事件虽然看似各自独立,但发生时机的凑巧却引起克拉克的重视,尤其是当俄国开始针对彩虹部队进行调查之后,更令克拉克怀疑这些恐怖行动是否与俄国有关？在彩虹部队与恐怖份子对峙之际,更大的危机却正一步步逼进,而且一旦爆发,将把人类推向灭亡汤姆克兰西藉由彩虹部队、前苏联克格勃特工、悉尼奥运会,以及一群对环境保护环有激进思想的美国科学家的叙述,进而巧妙地揭露整个故事的中心主题埃博拉病毒的秘密。全书充满许多在混密通信、传送和解密方面的最新科技发明,其逼真之程度,令各国政府都大感震惊,而且都不敢承认他写的是确有其事。